Laboratorije ovog odeljenja su opremljene za bakteriološka, serološka i parazitološka dijagnostika zaraznih bolesti životinja i zoonoza. Delatnost ovog odeljenja je:

• Bakteriološko ispitivanje organa uginulih životinja, sekreta, ekskreta i briseva poreklom od živih životinja itd.;

• Laboratorijska dijagnostika zaraznih bolesti pčela: Akaroza, Nozemoza, Varooza, Američka i Evropska kuga legla itd.;

• Serološka dijagnostika bakterijskih i virusnih bolesti: Antrax, Bruceloza, Enzootska Leukoza goveda, Gumboro bolest, Infektivna anemija konja, Kuga peradi, Leptospiroza itd.;

• Laboratorijska dijagnostika parazitskih bolesti: parazitska oboljenja kože i digestivnog trakta domaćih životinja, pregled mesa na trihinelozu metodama kompresije i veštačke i digestije itd